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慢性乙型肝炎是造成肝硬化、肝癌的罪魁祸首，其中80%的人是在未成年时期感染了病毒。然而却一直没什么好的办法可以治疗，很多慢性乙型肝炎患者，使用了多种物治疗，但均不，病情总发生反复。地治疗乙型肝炎已成为性的难题，乙型肝炎之所以难治，是因为乙型肝炎病毒常会嵌入肝的里面，结果是治疗后虽然找不到病毒，但还是可能会发病。
，乙型肝炎病毒有着坚硬的蛋白质外壳，可以起到保护病毒的作用，因此，治疗肝炎的物很难直接对病毒产生作用，必须依赖人体自身的功能。
第二，乙型肝炎病毒是在肝脏内进行复制，而治疗物必须是小分子物质才能进入肝内，并发挥抵抗病毒的作用。乙型肝炎病毒除了存在于人体肝脏以外，在其他一些器官、组织中也可出现，如脾脏、肾、胰、骨髓、淋巴结、睾丸、卵巢及皮肤等，因此抗病毒物要发挥作用，必须经过系统的、有足够疗程的治疗用。
第三，病毒在某些物作用下，会发生病毒基因变异，从而产生耐性或逃避。因而在选择治疗物时应当慎重。
第四，病毒在进入肝后，随着病程的延长，病毒的分可能与肝的发生整和，当肝脏的复制时，病毒的基因也会一同复制，一旦发生这种现象，治疗难度会加大。
第五，乙型肝炎病毒的复制方式与其他病毒不同，它会形成病毒复制的原始模板ccc，稳定贮存在肝核内，而一般的抗病毒对模板没果，因而患者在停后往往发生病情反复。
此外，乙肝垂直传播容易形成耐受。感染乙肝病毒的母亲通过胎盘感染胎儿，孩子出生后，由于系统发育不完善，功能不健全，不能地识别乙肝病毒，从而造成乙肝病毒感染。
