肝炎的发病机制至今尚未基本阐明，其发病与病毒、损伤等多方面因素有关。
(1)病毒因素：肝炎可由肝炎病毒等多种病毒引起，其原因是：
1)病毒的直接损伤：如肝炎病毒在肝内复制增殖，导致肝损伤。肝损伤的程度与病毒的数量和毒力有一定的关系。
2)病毒重叠感染：可以加重病情，乙型肝炎病毒合并丙型肝炎、丁型肝炎病毒感染阳性率较高，在肝炎的发病中起到一定作用。
3)HBV基因突变：不同基因型HBV的毒力不同，HBV的变异使病毒的致病力增加。已发现HBV基因前C区和C区的-基因变异与乙型肝炎，尤其是HBeAg阴性重型乙型肝炎有密切关系。
(2)因素：
1)肿瘤坏(TNF)：①TNF‘对肝有直接毒性作用；②TNF激活内酶的活性；③TNF可引起微循环障碍；④TNF与其他的协同作用。
2)白介素(IL)：IL1、IL6、IL2可作用于不同的靶，如淋巴、巨噬、内皮及肝，引起毒性作用。同时，它们相互作用，在肝炎损害中起重要作用。
3)内毒素：是革兰阴性菌壁的脂多糖成分，对肝有直接毒性作用，导致微循环障碍。另外，内毒素还可通过促进释放而引起肝损伤。
