慢性乙型肝炎治疗的总体目标是：大限度地抑制或消除HBV，减轻肝炎症坏及肝纤化，延缓和阻止疾病进展，减少和防止肝脏失代偿、肝硬化、HCC（肝癌） 及其并发症的发生，从而改善生活服务和延长存活时间。
慢性乙型肝炎治疗主要包括抗病毒、调节、抗炎保肝、抗纤化和对症治疗，其中抗病毒治疗是关键，只要有适应证，且条件允许，应进行规范的抗病毒治疗。
据一项针对医务人员的调查，45%被调查的医务人员不知道诊治乙肝应该遵循什么样的标准。中肝炎防治于05年公布的中肝炎的流行现状及其相关问题分析报告显示，仅有19%的人目前正在接受抗病毒这一正确的治疗方式。
